Правильно
Ступеня – єдиний правильний варіант написання слова в родовому відмінку. За українським правописом іменники другої відміни, що означають наукові і технічні терміни іншомовного походження у родовому відмінку однини мають закінчення –а, -я: ступеня, атома, префікса.
В результаті успішного захисту дисертації відбулося присудження наукового ступеня.
Види сільськогосподарських робіт залежать від ступеня розвитку рослин.
Відділення першого ступеня ракети відбулося успішно.
Неправильно
Ступеня
Але чи дійсно слово "ступінь" іншомовного походження? Це слово також може означати сходинку - ступінь. Як на мене, воно звучить, як українське, а не запозичене слово.